Jižní Súdán je federativní stát. Skládá se ze tří historických regionů, které se dále dělí na deset států. Regiony jsou bývalé súdánské provincie, které po odtržení Jižního Súdánu v roce 2011 přestaly mít samosprávnou funkci, samosprávné jsou dnes již jen jednotlivé federální státy. Hlavním městem je Džuba.