Karel Beneš (14. září 1932 Prachatice – 12. května 2006) byl český biolog, věnující se české rostlinné anatomii a cytologii.Podílel se na založení Jihočeské univerzity, kde vyučoval kurzy související s jeho odbornou prací (převážně na Biologické fakultě) a také kurzy zabývající se metodologií a filosofií vědy (na Biologické a Teologické fakultě).