Lužnice je přírodní památka evidenční číslo 5873 v okresech České Budějovice a Tábor. Chráněné území s rozlohou 432,24 ha bylo vyhlášeno 2. ledna 2014 a tvoří ho koryto řeky Lužnice od města Veselí nad Lužnicí až k soutoku s Vltavou. Ve Veselí nad Lužnicí zahrnuje také krátký úsek řeky Nežárky. Důvodem jeho zřízení je ochrana vzácných a ohrožených druhů rostlin a živočichů a jejich biotopů. Vyskytuje se zde např. velevrub tupý, piskoř pruhovaný nebo vydra říční.