Světový pohár v běhu na lyžích 2016/17 byl seriálem závodů v běhu na lyžích během zimní sezóny. Organizovala jej Mezinárodní lyžařská federace (FIS). Bylo odjeto celkem 32 závodů (28 individuálních, 4 týmové). Celkovými vítězi se stali Norové Martin Johnsrud Sundby (třetí triumf) a Heidi Wengová (první vítězství).