Tour de Ski 2008/09 je 3. ročník série závodů v běhu na lyžích. Obsahoval sedm závodů během devíti dnů od 27. prosince 2008 do 4. ledna 2009. Oproti dvěma předchozím ročníkům chyběl závod v Asiagu. Mezi místa konání závodů se nově zařadil německý Oberhof. Sprint volnou technikou se opět uskutečnil v Praze, ovšem tentokrát ne na Hradčanském náměstí, ale na Holešovickém výstavišti. Tour de Ski je součástí Světového poháru v běhu na lyžích.