Přírodní rezervace Týnecké mokřiny byla nově vyhlášena roku 2012 Nařízením Středočeského kraje č. 13/2013, kterým byla zároveň zrušena původní vyhlašovací vyhláška ONV v Kolíně o chráněném přírodním výtvoru. Rezervace se nachází severně od obce Kojice na pravém břehu Labe, na katastrálním území Týnce nad Labem.