Sezóna 2003/04 ČFL byla 11. sezónou v samostatné české fotbalové lize. Vítězství a postup do 2. fotbalové ligy 2004/05 si zajistil tým FK Ústí nad Labem. Týmy AFK Chrudim, FK Teplice „B“ a SK Sparta Krč sestoupily do divize.
Sezóna 2003/04 ČFL byla 11. sezónou v samostatné české fotbalové lize. Vítězství a postup do 2. fotbalové ligy 2004/05 si zajistil tým FK Ústí nad Labem. Týmy AFK Chrudim, FK Teplice „B“ a SK Sparta Krč sestoupily do divize.