Národní přírodní památka Žehuňský rybník byla v letech 1999–2006 součástí NPR Žehuňský rybník a NPR Žehuňská obora. Do roku 2010 byla vedena jako národní přírodní rezervace Žehuňský rybník. NPP Žehuňský rybník je součástí Ptačí oblasti Žehuňský rybník – Obora Kněžičky. V současnosti se jedná o rozlehlý Žehuňský rybník (258 ha) včetně přilehlých luk a mokřadů v nivě řeky Cidliny mezi obcemi Žehuň a Zbraň na rozhraní okresů Nymburk, Kolín a Hradec Králové.