Estonská fotbalová reprezentace do 21 let (estonsky Eesti U-21 jalgpallikoondis) je estonská mládežnická fotbalová reprezentace složená z hráčů do 21 let, která spadá pod Estonskou fotbalovou asociaci (EJL – Eesti Jalgpalli Liit). Reprezentuje Estonsko v kvalifikačních cyklech na Mistrovství Evropy hráčů do 21 let a v případě postupu i na těchto šampionátech. Fotbalisté musí být mladší 21.