Polypeptid je obvykle označení pro peptidový biopolymer složený z více než 10 aminokyselin. Mezi polypeptidy tedy podle této definice patří i bílkoviny (proteiny), jejichž řetězec však bývá ještě mnohem delší; někdy se však termíny polypeptid a protein v podstatě zaměňují. Jindy se však polypeptid definuje například jako polymer aminokyselin o délce menší než 50 aminokyselin.Polypeptid vzniká v buňce procesem translace na ribozomu.Menší než polypeptidy jsou oligopeptidy.