Selenocystein je zvláštní neesenciální proteinogenní aminokyselina podobná cysteinu, ale na rozdíl od něj má místo atomu síry atom selenu. Jedná se o výjimku z pravidla, že existuje pouze 20 proteinogenních aminokyselin – selenocystein se proto někdy označuje jako 21. proteinogenní aminokyselina (nicméně podobná situace je s pyrolysinem). Je to hlavní zdroj organického selenu.[zdroj?]Selenocystein se váže na speciální tRNA, která nese antikodon UCA.
